Scoperte nel 1590 dall’inglese James Lancaster, queste isole furono per secoli soggette al dominio arabo. Nel XIX secolo divennero colonia francese e territorio d’oltremare. L’attuale bandiera è stata adottata nel 2003 e riprende dalla precedente la mezzaluna e le stelle bianche in campo verde, richiamo all’Islam e alle quattro isole della Nazione, poste in un triangolo sull’asta. Nella bandiera ci sono quattro strisce orizzontali (gialla, bianca, rossa e blu), anch’esse simbolo delle isole.